In teoria sono sinonimi.

In pratica però qualcuno usa il termine elettrocuzione per indicare l'esecuzione della condanna a morte con la "sedia elettrica".

https://it.wikipedia.org/wiki/Folgorazione

http://www.treccani.it/enciclopedia/elettrocuzione...

Le folgorazioni avvengono sulla "via di Damasco" ...le elettrocuzioni (o scosse che dir si voglia) quando vieni a contatto con un potenziale elettrico che abbia una via di richiusura verso terra con impedenza dell'ordine dei kohm od inferiore

"elettrocuzione" è un pessimo neologismo dovuto soltanto ad un grossolano errore di traduzione, ma la parola in quanto tale NON ESISTE NE' IN ITALIANO NE' IN INGLESE (British English).

In American English esiste il neologismo "electrocution" ottenuto per contrazione di "electro execution" che ha l'unica traduzione corretta in "esecuzione capitale sulla sedia elettrica" e non in "elettrocuzione".

Non è di uso generico, ma solo per parlare di pena di morte in un contesto giornalistico (in contesti meno spicciativi si usa l'espressione non contratta o un'opportuna perifrasi).

http://www.treccani.it/vocabolario/ricerca/elettro...

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v. http://www.yanswersblogit.com/b4/2010/01/08/evita-...